为了还原历史的真相，让我们把时间回溯到第三次忍界大战末期，宇智波带土阵亡于神无昆桥之战，而野原琳死于木叶与雾隐的战争中。内心充满了伤痛的卡卡西回到了木叶，尽管卡卡西是上忍，但本质上还是个少年。
梦中，卡卡西的手上闪烁着千鸟雷光，雷切击穿了琳的胸口，琳用悲伤的眼神望着卡卡西，“卡卡西……”卡卡西从恶梦中惊醒，大口喘气，床上的闹铃在响个不停。琳被自己杀死的场景一次次让卡卡西从梦中惊醒，琳与带土的离去让卡卡西的心灵受到了很大的伤害。卡卡西起床洗手，眼中都是泪水，“洗不干净啊！”
风火土三国边境交界之处，奈良鹿久、秋道丁座、山中亥一带队出现在那里。土之国这一方来了一大群的岩忍，正用不友好的眼神注视着猪鹿蝶三人组。鹿久取出卷轴，“这是火影大人的书信，接着！”鹿久掷出卷轴，为首的岩忍接下来。鹿久道，“带给土影大人，请他尽快回复。”岩忍冷笑，“不用带给他，我现在就可以答复你！”为首的上忍挥手，岩忍们全部取出了战斗兵器，并且发出了不友好的笑声。
猪鹿蝶脸色大变，木叶这方也作出了战斗姿态。正在这时，风之国那方面也来人了，为首的赫然是四代风影，“先别急着动手！”沙丘上出现了几百名砂忍，数量远超过岩忍。岩隐上忍脸色大变，“什么，竟然是四代风影？”岩忍A道，“砂隐怎么来了？”四代风影道，“这里也是我们砂隐村的国境，不能让你们在这里大打出手。火药味浓了，当然要吹散。砂隐村不会坐视不理，希望你们动手前能明白这点！”
岩隐众人自知不敌四代风影和那个数量级的砂忍，只好悻悻撤退了。猪鹿蝶向四代风影道谢，因为这个时期战败的风之国已经是火之国的盟友。四代风影看了一眼猪鹿蝶三人身后的树林，转过身带着部队离去了。亥一道，“不愧是四代风影，果然，他发现了啊！”金宇四十五带着一大批木叶忍者从树林里走出来，他们是奉命来支援猪鹿蝶等人的。
鹿久道，“这次忍界大战岩隐一度攻入砂隐村，双方也算结下了深仇大恨。四代风影帮我们，也是在帮他们自己。”金宇道，“本来还以为有一场大战呢，没想到岩隐就这么虎头蛇尾离开了！”丁座道，“还是算了吧，这场忍界大战持续得够久了，希望和平早点到来啊！”亥一道，“那位三代土影可不是省油灯，他多半不会甘心吧！”金宇道，“我们木叶可不怕他们，团藏老师可是希望继续打下去的。”团藏是武斗派，任何妥协的和平建议，他都不接受。
山石林立的土之国，岩隐村，三代土影大野木召开了上层会议。岩隐村上上下下都非常团结，也没有木叶那么多政治势力，三代土影的威望之高，远非三代火影可比。一位大胡子长老道，“木叶缔结和平条约的请求，你打算怎样处理呢？”另一位白发苍苍的长老道，“当然是拒绝了！”这位白发长老也是武斗派，“即使木叶与砂隐结盟，也敌不过我们的团结。”其他上层人员也都议论纷纷。
大野木喝止，“安静！”大家都冷静下来，三代土影道，“岩隐的团结当然令我自豪，但我们岩隐村曾经孤注一掷投入上万忍者发动侵袭，但是神无昆桥一战，我们的入侵计划因金色闪光一人遭遇重大挫折，这是事实！”土影这么一说，其他人也都露出难过神色，那次惨败对岩隐打击太大了。大野木叹气，“而且我们与砂隐也结下了死仇，云隐也虎视眈眈，雾隐的态度更是捉摸不透。”
木叶，团子店，少年版的不知火玄间与并足雷同在这里吃丸子，雷同道，“听说这次要和岩隐村缔结和平条约了。”玄间叼着牙签，“一张纸片能有多大的约束力呢！”阿凯也出现了，“说得好！”猿飞阿斯玛与夕日红在里面吃东西，这些日后叱咤风云的上忍们现在还都是青涩的少年，充满了活力。雷同道，“你们也想想三代目的辛苦吧！”阿斯玛道，“总之漫长的战争终于结束了！”美丽可爱的红赞同，举起丸子，“和平，用团子来干杯吧！”
蒙着脸的卡卡西从团子店旁边经过，阿凯招手，“喂，卡卡西，过来吃团子吗？”蒙着一只眼的卡卡西看了这些伙伴们一眼，一言不发地冷漠走开。阿凯道，“最近这家伙真是冷淡啊！”玄间道，“有什么烦恼吗？”雷同道，“没办法啊，他根本没心情无所顾忌的瞎闹。”红有些难过，“是因为带土和琳的事情吗？”阿斯玛道，“嗯，肯定留下了很大的心理阴影啊！”卡卡西依然不能原谅自己亲手杀死琳的事情，那同样违背了带土的遗愿。
卡卡西来到了书摊前面，那里正在出售自来也的新书《忍者死战》，但是想起琳的事情，卡卡西也无心再看这么严肃的书籍，书掉落在地上。
火影办公室，猿飞等人在商量事务，土影的回复函已经到了。水户门炎道，“辛苦啦！”转寝小春道，“总算能松口气了！”团藏生气，“这样的条约你们就满意了？居然承认岩隐村在雨之国的活动，放弃要求赔偿的权力。这和打了败仗有什么区别？我肯定应该继续打下去，打到三代土影那个老顽固认输才行！”门炎道，“日斩你怎么看？”猿飞道，“继续打仗对已经筋疲力尽的木叶也是致命的。这是为意见统一作出的让步。”
团藏一拳擂在桌子上，“有很多盟友在这次战争中牺牲，这样做等于让他们白白死去！”门炎生气，“团藏，你应该知道木叶的情况，真的已经到了伤筋动骨的地步，不能再打下去了！”小春道，“是啊，团藏。我们木叶先后跟4大国开战，能撑到现在已经是极限了。”团藏不服气，还是想把战争继续下去。猿飞制止了双方的争吵，“责任都在我这个火影身上。”团藏没好气，“你打算怎么负责？”猿飞道，“我打算辞去三代火影的身份，让位给四代目。”
随后，猿飞4人加上奈良鹿久一起去见了火之国大名。大名道，“真可惜啊，三代目做的还不错呢！”团藏火大，怒视大名。大名欺软怕硬，立即菜了。团藏道，“要追溯根源的话，就因为三代目的想法太天真了，才让村子到了这个地步。目前我们需要的火影，是能领导村子变革，贯彻忍者守则的人。我们需要这样的人才……”大名道，“有这样的人选吗？”团藏正要毛遂自荐，大名急忙道，“团藏你就算了，你的眼睛与手臂都有残疾，不适合出任火影，太影响形象。”
团藏气得鼻子差点歪了，他的右眼与右臂在战争中受伤，只好整天用绷带缠着，没想到被大名当做形象不佳的借口。现在的团藏还不是20多年后无法抗衡的存在，毕竟猿飞还正当壮年，而且团藏在大家心里的地位实在堪忧。看到猿飞等人一言不发，团藏只好忍住怒气，“那我推荐三忍之首的大蛇丸。”这个时期，大蛇丸与团藏还在合作的蜜月期，二人关系甚佳，在无法推荐自己的情况下，团藏只好退而求其次，推荐大蛇丸了。
大蛇丸也的确有担任火影的资格，大名征求猿飞的意见。猿飞道，“可以说在战乱年代，大蛇丸确实是个才华横溢的天才。”团藏露出笑容，大蛇丸是猿飞的得意门生，团藏自以为猿飞不会反对。猿飞语气变重了，“然而他心中藏着恶意和野心，不能将火影的重任托付到这种人身上。”团藏恼怒，“三代目！”猿飞道，“我推荐同为三忍之一的自来也！”大名正要表示赞成，“自来也吗？那就……”
团藏立即道，“我反对，自来也这人太过散漫，并且好－色，风评不佳，还擅自将忍术传授给外人，这种人绝不可以当火影！”团藏这是不满猿飞的推荐人选，反将一军。门炎也无奈，“自来也的确有些吊儿郎当，有些难当大任的样子。”小春道，“本来同为三忍的纲手姬是最合适的人选，可惜她又……”大名头疼，“那除了木叶三忍，还有其他合适的人选吗？”猿飞想了想，“我推荐波风水门。”
小春道，“自来也的徒弟吗？是三代目的徒孙啊！”门炎道，“这倒是个合适的人选，人称金色闪光的精英啊！正气大方，温柔亲和，实力强大，的确是不可多得的影级忍者。”团藏急得满头大汗，想要反对这个推荐，但是却说不出波风水门有什么缺点。大名有些看好戏一样看着团藏，团藏愤然站起来，“水门太年轻了！这个、威望不足……”猿飞站起来力挺水门，“他赢得了神无昆桥之战的胜利，是引导第三次忍界大战终止的大功臣！”
团藏什么也不顾了，就是一个劲地反对，可却说不出过硬的理由来。猿飞与团藏僵持不下，大名只好征询另外两位顾问的意见。门炎与小春一起表示赞同，支持波风水门出任四代火影。火之国的其他官员也没有异议，对充满阳光气息的水门充满好感，一致表示同意。团藏孤掌难鸣，大名最后也表示了支持，就这样四代火影的人选就确定下来了。团藏气得七窍生烟，却又无计可施。
回到木叶后，三代火影召见了波风水门。猿飞道，“我一直认为你是火之意志继承者，我要将木叶，还有忍者世界的未来托付给你。你愿意接受吗？”水门道，“我会努力回应三代目的信任！”猿飞道，“本打算在一个更好的环境里举办继任仪式，但眼前你的路还很坎坷啊！”水门道，“我有心理准备。”猿飞露出笑容，“相信你一定能行的！”
水门道，“我想任命金宇担任四代火影的护卫队队长，不知道可以吗？”猿飞很满意，“嗯，他是很合适的人选，不仅是你的搭档，还是团藏的学生。这样的话，团藏那边就不会那么抗拒了。政治就是妥协的艺术，看来你已经明白了。很好，你马上就是四代火影了，按你自己的想法去做吧，不用事事征询我这个老家伙的意见。未来掌握在你们年轻人手里，我就退居二线，享享清福吧！”
街上，水门遇到了金宇。金宇道，“恭喜你了，水门！这次你的愿望实现了，团藏老师被气得半死……当上火影也是他的愿望呢！”水门道，“那还真是对不住了呢！回头你替我向团藏长老说声抱歉吧！”金宇笑道，“完全不用，其实我也不赞成老师当上四代火影。怎么说呢，总感觉团藏老师心里的黑暗太多了些，什么事情都往最阴暗的地方想。好啦，不说这些，我们一起去庆祝一下吧！”
水门道，“不急，我还要告诉你一件事情，我之前的承诺依然有效，我成为四代火影时，你就担任我的护卫队队长。”金宇大喜，“真的吗？太好了！这样一来，我的愿望也就实现了呢！火影护卫队队长，这个名字听起来就很拉风啊！”
经过三代火影的努力，木叶与岩隐村缔结了和平条约。而波风水门也当上了第四代火影，继承了火之意志的他必将会带来前进的变革。
两人互相祝贺调侃之际，后面跑来了一个大约10岁左右的孩子，嘴里喊着“金宇老师”，正是少年版的月光疾风。水门问起来，金宇道，“是月光家的孩子，很有天赋的苗子，就是身体有些不好。我答应了他家的长辈，做这个孩子的老师。”